Bioinformatyczny klaster

Sun ogłosił 29 marca dostępność rozwiązania noszącego nazwę Sun Fire Starter Cluster for Bioinformatics. Jest to wstępnie skonfigurowany klaster dla bioinformatyki (sprzęt plus oprogramowanie), na którym można uruchamiać mniej wymagające aplikacje.

Klaster zaprojektowano z myślą o małych laboratoriach i niewielkich systemach informatycznych, których nie stać na zatrudnienie wykwalifikowanej kadry informatyków.

Starter Cluster jest "odchudzoną" wersją 32 węzłowego klastra, który pojawił się w ofercie firmy Sun w 2003 roku. Sun doszedł do wniosku, że wiele firm poszukuje mniejszych klastrów, dysponujących mniejszą liczbą węzłów. I tak powstał klaster Sun Fire Starter Cluster for Bioinformatics, który można szybko zainstalować i utrzymywać w ruchu, nie będąc w tej dziedzinie specjalistą.

Klaster jest instalowany w 19 calowej szafie wyposażonej w rolki, tak aby można go było łatwo wsuwać pod biurko. System nie wymaga specjalnego zasilania czy chłodzenia. Wystarczy go podłączyć do zwykłego gniazdka i jest od razu gotowy do pracy.

System w podstawowej konfiguracji zawiera cztery węzły obliczeniowe (osiem procesorów), ale użytkownik może go łatwo rozbudować do 32 węzłów, a jeśli jest to konieczne, dołączyć do niego dodatkową pamięć masową.

Sun sprzedaje klaster razem z systemem operacyjnym, oprogramowaniem MPI (Message Passing Interface), N1 Grid Engine (do zarządzania klastrem) i VIBE (Visual Integrated Bioinformatics Environment; produkt firmy Incogen służący do analizowania danych biometrycznych).

Sun obiecuje, że za kilka miesięcy będzie sprzedawać klaster razem ze swoim oprogramowaniem BioBox (aplikacja oparta na otwartym źródle, oferująca biometryczne algorytmy zoptymalizowane dla systemów Linux i Solaris).

Obecnie użytkownicy mogą kupować klaster oparty na procesorach Xeon (Intel), pracujący pod systemem Linux. W połowie roku dostępny będzie klaster z systemem Solaris, w którym instalowane będą procesory Opteron (AMD). Cena klastra w podstawowej konfiguracji - ok. 22 tysięcy USD.

W celu komercyjnej reprodukcji treści Computerworld należy zakupić licencję. Skontaktuj się z naszym partnerem, YGS Group, pod adresem [email protected]

TOP 200