Naukowcy na Galerze
- Rafał Jakubowski,
- 11.09.2007
Nowy superkomputer w Centrum Informatycznym TASK będzie wykorzystywany do celów naukowo-badawczych w dziedzinie chemii, fizyki i inżynierii.
Nowy superkomputer w Centrum Informatycznym TASK będzie wykorzystywany do celów naukowo-badawczych w dziedzinie chemii, fizyki i inżynierii.
Być może projekt zakończy się wcześniej. "Wcześniejsza instalacja uwarunkowana jest terminem oddania do użytku, będącego w fazie wykończeniowej, nowego gmachu Informatyki Politechniki Gdańskiej, gdzie znajdzie się nowa siedziba CI TASK ze specjalnie wybudowaną, profesjonalną, nowoczesną serwerownią uzbrojoną we wszystkie niezbędne media, tj. zasilanie, klimatyzację i sieć wraz z systemami sterowania i zabezpieczenia" - opowiada Mścisław Nakonieczny, dyrektor CI TASK.
Aktualny stan zaawansowania prac wykończeniowych pozwala przypuszczać, że instalacja klastra rozpocznie się w drugiej połowie października. Dostawca rozwiązania - konsorcjum Wasko i Action - kompletuje obecnie niezbędny do tego sprzęt. Projekt klastra finansowany jest w połowie z dotacji Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego, a w połowie ze środków z funduszu rozwoju CI TASK. Inwestycja nie będzie dofinansowana ze środków unijnych. "Trudno pojedynczemu Centrum, bez utworzenia dużego konsorcjum, uzyskać unijne fundusze na inwestycje sprzętowe" - tłumaczy Mścisław Nakonieczny. "Należy także wspomnieć o specjalnych warunkach finansowych, jakie TASK uzyskał od Intela w związku z podpisanym w 2006 r. Memorandum of Understanding" - dodaje. Umowa ta dotyczy współpracy w zakresie testowania nowych rozwiązań HPC, czyli komputerów dużej mocy.
Ponad trzysta węzłów
Maksymalna moc obliczeniowa Galery wynosi 50 TFLOPS-ów. Klaster składać się będzie z 336 węzłów (nodów) wykorzystujących układy Intel Xeon Quad-Core. Procesory będą instalowane na platformach SMP w konfiguracji dwuprocesorowej. W jednej obudowie o wysokości 1U umieszczone zostaną dwie dwuprocesorowe płyty główne. Pojedynczy węzeł będzie posiadał 4 procesory czterordzeniowe i będzie połączony z pozostałymi siecią InfiniBand pracującą w technologii DDR z przepustowością 20 Gb/s.
Sieć będzie służyć do komunikacji między procesorami podczas obliczeń. Do stworzenia sieci pomocniczej zostanie wykorzystana technologia Gigabit Ethernet. Klaster będzie pracował pod kontrolą systemu operacyjnego Linux, a do zarządzania zostanie wykorzystane autorskie oprogramowanie firmy Wasko Open Eye Cluster Monitoring oraz własne oprogramowanie CI TASK. Do zarządzania zasobami użyty zostanie pakiet PBS/Torque/Maui.
Superkomputer Galera 50 TFLOPS-ów - to jego moc obliczeniowa 1344 procesory Intel Xeon Quad-Core zostaną wykorzystane do jego budowy 20 Gb/s to przepustowość sieci InfiniBand pracującej w technologii DDR, którą połączone będą węzły tego superkomputera
Wykorzystywane oprogramowanie Linux, Wasko Open Eye Cluster Monitoring, PBS/Torque/Maui, własne aplikacje CI TASK
Dla inżyniera i medyka
Podobnie jak poprzednio tworzone w CI TASK klastry, Galera będzie wykorzystywana do celów naukowo-badawczych, głównie w dziedzinie chemii, fizyki i inżynierii. Obecnie w Centrum realizowanych jest kilkadziesiąt dużych projektów. Z pewnością Galera wesprze projekt FLIERT, w ramach którego prowadzone są komputerowe analizy oporów powietrza i aerodynamiki samolotów bazujące na wynikach badań prowadzonych w tunelu aerodynamicznym European Transonic Wind Tunnel w Kolonii. Celem tego projektu jest stworzenie symulacji lotu samolotów Airbus. Ma to umożliwić zmniejszenie oporów powietrza, zwiększenie szybkości, a także zmniejszenie zapotrzebowania na paliwo. Innym projektem, który wesprze Galera, jest prowadzony we współpracy z Rolls-Roycem AITEB-2. Dotyczy on analizy przepływu powietrza w turbinach silników lotniczych, w celu uzyskania większej wydajności i bezpieczniejszych rozwiązań.
Wreszcie nowy superkomputer ma pomóc w zwalczaniu raka. W CI TASK prowadzony jest projekt związany z badaniami nad substancjami o potencjalnym wykorzystaniu w terapii antynowotworowej. Projekt ma na celu lepsze zrozumienie powstawania uszkodzeń DNA zawierającego zmodyfikowane nukleotydy, pod wpływem promieniowania UV i jonizującego. Badania te mogą być podstawą do projektowania nowych terapii antynowotworowych, opartych na znacznie łagodniejszych dawkach promieniowania. Zrozumienie mechanizmu uszkodzeń DNA wymaga badania znacznie większych modeli nukleotydów niż jest to możliwe z użyciem obecnie dostępnego klastra. Galera zapewni też większą dokładność.
Komercyjne plany
Galera ma być także udostępniana na zasadach komercyjnych. "Obecnie, co prawda w niewielkim zakresie, ale udostępniamy zewnętrznemu klientowi klaster Holk do symulacji zanieczyszczeń środowiska. Liczymy, że współpraca w tym zakresie będzie również kontynuowana na nowym klastrze" - mówi Mścisław Nakonieczny. Galera ma umożliwić stworzenie bardziej atrakcyjnej oferty niż dotychczasowa. "Obserwujemy rosnące zainteresowanie firm komercyjnych prowadzeniem u nas symulacji. Można powiedzieć, że ze strony firm mamy sondowanie, czy projekty oparte na badaniach symulacyjnych mogą się opłacać, jakie są możliwości i warunki stawiane przez nasze centrum. Docierają już do nas informacje o zainteresowaniu obliczeniami na nowym klastrze przez duże koncerny" - dodaje Mścisław Nakonieczny.
<hr>